18歲的基因定序先鋒基龍米克斯，不只持續發展婦幼健康及癌症基因檢測，更用AI切入藍海市場，發展新商業模式，從精準醫療跨足AI選豬，去年祭出的全基因組機器學習關聯性分析法，將是進一步橫向擴展各個垂直領域的重要基礎。
出生7天的小豬，能否成為每年550萬頭養殖豬之中的「天選之豬」？只要在小豬身上抽出3 c.c.血液，送進實驗室中掃描小豬DNA上的30億個鹼基，經過超級電腦的高速運算，基龍米克斯運用「全基因組機器學習關聯性分析法」快速比對種原資料庫，從血液裡找出基因標記，就能用AI預測這隻小豬是否有做為種豬的潛質，目前掌握這項精準預測技術的公司正是基龍米克斯。
基龍米克斯是一家誕生於千禧年的基因檢測公司，當時是生物科技風起雲湧的黃金年代，總共有十幾家陸續成立，時至今日，基龍米克斯不僅是少數倖存者，營運規模也從創業初期3千萬資本額的6人團隊，發展至今成為近6億資本額的120人公司。
放眼精準醫療，從自己最具優勢的地方開始做起
對大多數人來說，基龍米克斯也許是陌生的，然而，這個從六人團隊開始扎根市場的生物科技公司，一路走來跌跌撞撞，卻也扎扎實實地寫下了自己的傳奇故事。基龍米克斯的創始成員全都來自中研院水稻基因體中心，這是一個技術與中、美、法、日能並駕其驅的團隊，基龍米克斯董事長游卓遊說：「水稻有十對染色體，當時有技術能力完成一整對染色體基因解碼的國家只有台、中、美、法、日，其中中研院完成水稻第五對染色體的完整解碼，讓台灣在水稻基因解碼領域佔有關鍵角色。」
2013年，基龍米克斯因緣際會與海洋大學合作完成櫻花鉤吻鮭的基因解碼，打下了基因定序、運算、分析生物大數據的基礎。2015年順勢轉進精準醫療市場，積極投入產前檢測和癌症檢測。但「這裡殺成一片紅海！」游卓遠說。光是做產前基因檢測的業者就有五家，而台灣新生兒不到20萬人，其中會做基因檢測的產婦不到10%。
游卓遠指出，所有基因檢測公司都想像未來每個人可以做基因解碼，得到保健資訊、健康風險的資訊，應用在投藥及治療上。然而，一來病患不會跳過醫院做基因檢測，二來基因檢測是自費項目，是精準醫療難以推動的兩大主因。
此外，缺乏台灣健保資料庫及人體基因解碼，台灣很難發展真正的精準醫療。即便業者跟單一或少數醫院合作，也很難發展出跨醫院的全國殺手級應用。游卓遠表示，台灣精準醫療要等中研院公開「台灣人體生物資料庫」後，才有可能啟動。
游卓遠直言，「以前我們沒辦法做數位轉型，是因為過去只是幫別人代工做基因定序檢測，沒辦法把產出的資料做加值應用，創造我們的服務價值。」但是，資料產出的技術門檻越來越低，基龍米克斯正在找尋藍海市場之際，恰巧看到國外指標性的育種、種苗公司都投入基因定序的精準農業，回看台灣，目前還看不到競爭者想投入AI農業基因定序市場。他進一步指出，「我們必須帶動這個風潮，從自己最具優勢的地方開始做起。」
基龍米克斯謹慎評估後，選擇從市場接受度最高，而且已經有現成檢定業務及完整性狀種原資料庫的「種豬」做起。游卓遠表示，用AI預測種豬，是基龍米克斯第一個產出價值應用的嘗試，為的是累積AI應用、資料庫、知識的技術能量。農委會畜產試驗所曾預估，結合AI與基因定序，種豬產值可望達到34億元。口蹄疫爆發前的全盛時期，台灣一年有1,500萬頭豬，還能外銷日本。如今台灣人每年要吃800萬頭豬，一年的產值可達700億元。
用AI預測種豬的關鍵：基因解碼、種原資料庫
先切入物種的基因定序及AI應用，聽起來與人體基因定序天差地遠，對基龍米克斯來說卻是多年來能量蓄積的合理展現。
要怎麼樣用AI預測小豬是否為優良種豬呢？游卓遠表示，首先得定義優良種豬，40年來農民全憑多年經驗判定小豬走路姿勢等外觀條件，再決定是否把小豬送到畜產試驗所中央檢定站進行「種豬」的性能檢定。也就是要讓小豬在一致環境因素下養殖三個月，並且追蹤各種數據變化，比如體重變化、背脂厚度、腰眼肉厚度、飼料換肉率等數據，才能選出高繁殖力及屠體性能好的種豬，通過中央的檢定，整個過程「就像小豬的選美比賽一樣，長得好的種豬，拍賣價格就高。」游卓遠說。
如今有了AI及基因定序技術，小豬出生168小時後在身上抽取血液，就可以知道這隻小豬能否繼續被栽培為種豬，成為台灣每年550萬頭在養豬當中能被送去做性能檢定的1000隻種豬之一，大幅省下養豬農的時間和成本。
「過去要花幾百萬才能做一隻豬的基因解碼，現在只要花幾千元！」游卓遠指出。這個轉折的關鍵主要是因為基因定序技術快速演進，以及AI分析所需要的數據量已經有相當基礎。台灣從1975年就開始做種豬性能檢定，40年來保存完整的種豬種原資料庫及種原庫，每隻性能檢定的小豬都有完整記錄，包括耳號、名字、父母系譜、性狀記錄，還有如血液、組織樣本等生物材料。2010年之後技術快速演進，產出資料的成本下降，也讓基因解碼的結果開始能延伸應用產生價值。
有了完整的種原資料庫，再加上基龍米克斯為2,500頭豬做出的基因解碼，過程中，結合農委會畜產試驗所、宜蘭大學、展東科技大學、華碩健康、資策會和國網中心超級電腦等跨領域的資源，讓基龍米克斯能進一步分析出長得快的種豬基因型，藉由這些基因型去預測小豬未來能否成為種豬，產出讓農業提升價值的結果，基因檢測終於能實踐在「預測未來」。
游卓遠指出，AI選豬的應用未來可分為三階段，第一，短期目標是透過小豬的性能檢定，將台灣40年來選豬的經驗，利用基因定序和機器學習AI技術，教電腦選出優良的種豬。第二，長期規劃的目標是投入育種管理，用基因定序技術做出配種建議，生出符合市場需求的小豬。第三，永續發展的目標是做好台灣豬的種原保存。
「物種基因解碼像是插旗子，為了要找性狀的關聯性。我們必須把台灣物種的基因解碼通通記錄下來，相信有朝一日會用得上。」基龍米克斯的發展至此，游卓遠也不諱言，現階段切入種豬等精準農業藍海市場，是AI數位轉型的一個起點，也是一個重要的過程，最終目標仍是要「為未來的精準醫療做準備」，透過精進AI和基因定序技術，當未來有機會開放「台灣人體生物資料庫」時，基龍米克斯將能快速推出精準醫療的相關應用。
未來，基龍米克斯的發展策略，將會把AI應用橫向擴展到農業產業各領域，先從畜產的豬開始，接下來計畫擴及水產養殖、農作物等行業。游卓遠細數石斑魚、九孔、草蝦、香蕉、豬及蘭花，都是台灣過去的驕傲，卻全都盛極而衰，雖然有栽培管理和開發新品種的能力，卻難以規模化。他感歎，「台灣的種植、養殖經驗被學走之後，栽培成本高，就沒有競爭力了。」
因此，基龍米克斯想整合學界研究成果，再利用基因定序及AI的優勢強化農業產業的競爭力，讓台灣農業產業持續保持領先。游卓越說「這件事必須要有人做，我們要幫台灣農業的未來做好準備！」
